Comprende due importanti massicci, il Campo dei Fiori e la Martica, separati dalla Valle della Rasa, dove nasce il fiume Olona. Dalle cime si domina la città di Varese, i laghi prealpini e la Pianura Padana fino agli Appennini e le montagne dell’arco alpino centro-occidentale.
Il Parco spicca per la sua diversità ambientale, con estesi boschi di castagno e faggio, aree aperte, pareti rocciose e aree umide.
Caratteristico è il sistema di grotte carsiche, tra i più estesi e studiati in Italia.